Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD1AQ96CP6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms