Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP1MTQ969P6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms