Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP13Q92995 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP13Q92995 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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USP13Q92995 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP13Q92995 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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USP13Q92995 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP13Q92995 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP13Q92995 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP13Q92995 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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