Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN4Q92575 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms