Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TOPBP1Q92547 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms