Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF4Q8WZA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF4Q8WZA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF4Q8WZA2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms