Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms