Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNED1Q8TER0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNED1Q8TER0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms