Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3RF3Q8TEJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF3Q8TEJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms