Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
RB1CC1Q8TDY2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms