Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCOLN3Q8TDD5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms