Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms