Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYRIPQ8NFW9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms