Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms