Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.1 ms