Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf62Q8N4C0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf62Q8N4C0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms