Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms