Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT1Q8IXI2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms