Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3FQ8IUX4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3FQ8IUX4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms