Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB4Q86W47 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms