Protein–RNA interactions for Protein: Q86T82

USP37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP37Q86T82 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP37Q86T82 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP37Q86T82 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms