Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS2ST1Q7LGA3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms