Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SV2AQ7L0J3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms