Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms