Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms