Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms