Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms