Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms