Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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