Protein–RNA interactions for Protein: Q6TGC4

PADI6, Protein-arginine deiminase type-6, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI6Q6TGC4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI6Q6TGC4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI6Q6TGC4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms