Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms