Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND1BQ6P3S1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND1BQ6P3S1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms