Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms