Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP5Q6NZY7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms