Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms