Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms