Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SUMO4Q6EEV6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms