Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPECC1LQ69YQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms