Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
VIRMAQ69YN4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VIRMAQ69YN4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms