Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INTS3Q68E01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms