Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG16L1Q676U5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms