Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms