Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF220Q5VTB9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms