Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms