Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOGA3Q5TF21 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms