Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms