Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1TD1Q5T7N2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms