Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms