Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LDLRAP1Q5SW96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LDLRAP1Q5SW96 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms