Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms